١١ ـ مدرسة الآخوند الصغرى وتحتوي على ١٢ غرفة وقد بناها الشيخ ملا كاظم الخراساني أيضا ١٣٢٨ ه وموقعها في محلة البراق.
١٢ ـ مدرسة السيّد كاظم اليزدي وتحتوي على ٨٠ غرفة وقد بناها آية الله السيّد كاظم اليزدي سنة ١٣٢٥ ه ١٩٠٧ م. وموقعها في محلة الحويش.
١٣ ـ مدرسة الشيرازي بجوار الصحن الشريف من جهة باب الطوسي وفيها قبر المرحوم المجدّد الميرزا حسن الشيرازي وفيها أيضا قبر المرحوم آية الله الميرزا عبد الهادي الشيرازي المتوفى ١٣٨١ ه.
١٤ ـ مدرسة البروجردي وتحتوي على ٦٤ غرفة وقد بناها السيّد آقا حسين الطباطبائي البروجردي ١٣٧٣ ه ١٩٥٣ م بواسطة الشيخ نصر الله الخلخالي وموقعها بالقرب من الصحن الشريف.
١٥ ـ مدرسة جامعة النجف الدينية ، وتحتوي على حوالي ٢٣٨ غرفة قام بالانفاق عليها عمدة الاعيان والأخيار الحاج محمّد تقي اتفاق التبريزي وأشرف على عمليّة البناء حجة الإسلام السيّد محمد كلانتر النجفي وموقعها في حيّ السعد وتعتبر هذه المدرسة من اضخم المدارس العلمية بمساحة خمسة آلاف متر مربعة في النجف الأشرف.
١٦ ـ مدرسة المهدية وتحتوي على ٢٢ غرفة وقد بناها الشيخ مهدي ابن الشيخ علي آل كاشف الغطاء حدود سنة ١٢٩١ ه وموقعها خلف جامع الطوسي.