٣. وجود بسيارى از نسخههايى كه به خط مؤلفان آنهاست.
٤. دارا بودن نسخى كهن در علوم مختلف اسلامى.
تا كنون پيش نويس فهرستِ ٢٥٠٠ نسخه خطى اين كتابخانه تهيه شده كه در اين جا به معرفى نسخههاى مهم آن در سه بخش پرداختهايم :
الف : نسخههاى قديمى وكهن : در اين قسمت نسخههايى كه تا پايان سده دهم كتابت شدهاند را آوردهايم.
ب : نسخههاى خط مؤلف : كه در اين بخش كتابهايى را كه به خط مؤلفين آنها بوده ذكر شدهاند واز آوردن نسخى كه نسبت آنها به خط مؤلف مشكوك بوده صرف نظر كردهايم.
ج : نسخههاى داراى اجازه : كه در اين فصل به اجازاتى كه به خط مجيزان آنها بوده اكتفا شده واز ذكر اجازات منقوله يا مجموعه اجازاتى كه به خط يكى از كاتبان گردآورى شده بود ، پرهيز كردهايم.
نسخههاى خطى اين كتابخانه از شماره مسلسل (٢٠٠١) به بعد در مركز احياء ميراث اسلامى ، شمارهگذارى شده است.
[نسخههاى قديمى]
(٢٠٠١) شرح الشافية ، ازجار بردى ، به خط عطاء الله بن عبد الغفار بن عبد الكريم ، سلخ صفر ٧٧٥ در مدرسه مرجانيه بغداد.
(٢٠٠٥) مجموعه : ١. مكارم الأخلاق ، از طبرسى ٢. قانون العدالة ، از حسين بن سيف الدين هروى ٣. أربعين حديث (يا اربعين بهايى) ، از عماد الدين حسن طبرى ، به خط محسن على ميرى اردستانى ، در ربيع الثانى ٩٣٣.
(٢٠٠٧) مجموعه : ١. إجازة الحديث ، از نور الدين على بن عبد العالى كركى ٢. المثلثات اللغوية ، از قطرب ٣. الأمان من أخطار الأسفار والأزمان ، از على بن طاووس ٤. المجتنى من الدعاء المجتبى ، ازهمو ٥. محاسبة النفس ، ازهمو ٦. فرحة الغرى ، از احمد بن طاووس ٧. الآداب الدينية ، از طبرسى ٨. الأربعون حديثاً ، از شهيد اول ، به خط محمد بن ابراهيم اوالى بحرانى ، در سال ٩٥٧ و ٩٥٨ در تبريز واردبيل.
(٢٠٣٧) مناهج اليقين في اًصول الدين ، از علامه حلى ، كتابت ١٠ ربيع الاول ٧٢٠.