في الأخلاق : ديباجة الأخلاق الناصريّة ، خاتمة الأخلاق الناصريّة ، أوصاف الأشراف ، ترجمة الأخلاق الناصريّة.

في التفسير : تفسير سورة الإخلاص والمعوّذتين ، تفسير سورة العصر.

في التاريخ : واقعة بغداد.

في الفقه : جواهر الفرائض ، ويطلق عليه «الفرائض النصيريّة».

في الفلك : الصبح الكاذب ، التذكرة وهو في علم الفلك.

في الطبّ : تعليقة على قانون ابن سينا.

في التربية والتعليم : آداب المتعلّمين.

في المنطق : أساس الاقتباس ، تجريد المنطق.

في الفلسفة والحكمة : شرح الإشارات ، رسالة في العلم الاكتسابيّ ، الرسالة النصيريّة ، رسالة في إثبات الجوهر المفارق ، إثبات العقل الفعّال ، بقاء النفس بعد دثور البدن.

في علم الكلام : تجريد العقائد ، الفصول النصيريّة ، تلخيص المحصّل ، مصارع المصارع ، رسالة في الجبر والاختيار ، رسالة السير والسلوك ، معرفة النفس ، رسالة في العصمة ، رسالة في أصول الدين ، رسالة في الإمامة.

وفاته :

توفّي المحقّق الطوسيّ في آخر نهار يوم الغدير سنة اثنتين وسبعين وستّمائة (٦٧٢) ، وكانت مدّة عمره خمسا وسبعين سنة وسبعة أشهر وسبعة أيّام ، ودفن في مشهد مولانا الكاظم عليه‌السلام.

قال المحدّث النوريّ : من الاتّفاقات الحسنة أنّهم لمّا احتفروا الأرض لدفنه فيها وجدوا قبرا مرتّبا مصنوعا لأجل دفن الناصر العبّاسيّ ، ولم يوفّق الناصر للدفن فيه ، ودفنوه في الرّصافة ،