( شرح الإشارات ) ذكرت الأصل في ( ج ٢ ـ ص ٩٦ ) وشرحه للخواجة نصير الدين يأتي باسمه مشكلات الإشارات طبع مكررا.
( ٥٩١ : الحاشية عليه ) للسيد الأمير إبراهيم بن قوام الدين حسين بن عطاء الله الحسيني الهمداني المتوفى (١٠٢٥) كما في جامع الرواة وذكر الحاشية في مناقب الفضلاء.
( ٥٩٢ : الحاشية عليه ) على قسم الإلهي خاصة. للسيد الأمير محمد إسماعيل بن محمد باقر بن الأمير إسماعيل بن عماد الدين ، دفين خاتون آباد ـ أصفهان ـ الحسيني الأفطسي المعروف بخاتون آبادي المولود في (١٠٣١) والمتوفى (١١١٦) كما أرخه السيد المير عبد الكاظم بن محمد صادق الخاتون آبادي في مشجرة الخاتون آباديين المؤلفة في (١١٣٩). وذكر الحاشية له الشيخ عبد النبي القزويني في تتميم الأمل.
( ٥٩٣ : الحاشية عليه ) للمولى محمد باقر بن محمد مؤمن الشهير بالمحقق السبزواري المتوفى (١٠٩٠) رأيت نسخه منها في موقوفة الحاج عماد الفهرسي في الرضوية وقد فرغ منها في ( ١٢ ـ ذي القعدة ـ ١٠٧٥ ) وتعرض للرد عليه غالبا المحقق الخوانساري في حاشية شرح الإشارات التي سنذكرها.
( ٥٩٤ : الحاشية عليه ) للمحقق الآقا حسين بن جمال الدين محمد الخوانساري المتوفى في (١٠٩٩) قال في الرياض ( إنها على شرح الإشارات ومتعلقاته من الطبيعي والإلهي وهي تامة ) أقول توجد نسخه منها في مكتبة الشيخ علي كاشف الغطاء ، وأخرى في مكتبة الصدر وعلى هذه النسخة حواش لولده الآقا جمال الدين ، وتاريخ كتابتها في (١١١٣) ونسخه في كتب علي محمد النجف آبادي في التسترية وهي بخط أبي الفوارس بن أبي المكارم الدماوندي كتبها في (١١٩٠) وهي كما ذكره في الرياض حاشية على نفس الشرح وعلى تعليقاته كحواشي السيد الشريف الجرجاني ومحاكمات القطب الرازي بين شرحي الخواجة الطوسي والفخر الرازي وعناوينه ( قوله ، قوله ) أو ( قال المحاكم ) أول الحاشية ( قال المحاكم : قد عرفت فيما سبق أن الإشارة إلخ. أي الحكم المصدر بها إلخ ) ونسخه خط يد المحشي رأيتها في كتب ( حفيد اليزدي ) في النجف ، قال في آخرها ( هذا ما تيسر لنا من الكلام على الشرح