جامع النهر : بناه الأمير علاء الدين يونس الحرفوش (ت ١٣٩٣) وجدّد بناءه يونس الحرفوش في القرن السابع عشر.

مسجد رأس العين أو جامع الملك الظاهر بند قداري : بقايا مسجد أثري عائد إلى الحقبة المملوكيّة.

جامع أبي الفداء أو جامع الصاغة : أثري.

مسجد السعدين أو قبّة الأمجد بهرام شاه : أثري يعود إلى الحقبة المملوكيّة.

جامع الحنابلة.

كاتدرائيّة القديستين بربارة وتقلا للروم الكاثوليك : وقد خصّت القديسة بربارة باعتبار مميّز في بعلبك لأنّ التقليد يقول بأنّها نشأت فيها ، وقد سمّي معبد فينوس في القرن الرابع معبدا لها تيمّنا بإيمانها واعتناقها العميق للمسيحيّة ، ومن ثمّ بنيت كنيسة لها في المدينة ، أمّا الكاتدرائيّة الكاثوليكيّة في بعلبك فقد اكتمل بناؤها ١٨٩٧ ، وإلى جوارها كنيسة أقدم منها بناها المطران أثناسيوس عبيد ١٨٣٠.

مبنى مطرانيّة الروم الكاثوليك : بني مع الكنيسة القديمة ١٨٣٠.

كنيسة مار الياس النبي : ذكر طرازي أنّ السريان قد بنوها في بعلبك بعد استقلالهم ببطريركيّتهم الإنطاكيّة في القرن السادس ، وتولّى رعايتها الأسقف أنتيما ، وبقيت وجماعتها السريانيّة حتّى القرن الثامن عشر إذ بدأ السريان يرتحلون عن بعلبك ، وانحازت البقيّة الباقية منهم إلى ملل أخرى ولا سيّما إلى الروم الملكيّين ؛ كنيسة مار جرجس : رعائيّة كاثوليكيّة ؛ كنيسة السيّدة : رعائيّة مارونيّة ؛ كنيسة سيّدة البشارة : رعائيّة أرثذوكسيّة.

حسينيّة العلّاق ؛ حسينيّة الإمام الخميني ؛ حسينيّة آل رعد ؛ حسينيّة آل اللقيس ؛ حسينيّة آل عثمان في حيّ الشميس ؛ مبرّة الإمام المهدي.