من تفسير القرآن منسوبة للصادق عليه‌السلام رقمها : (٥٢٥٣).

وفي الذريعة (٤ / ٢٦٩) : «(١٢٥١) تفسير الإمام جعفر بن محمّد الصادق ، هكذا وصف في المطبوع من فهرس مكتبة علي پاشا بإسلامبول وعدّ من الكتب الموجودة في المكتبة : (ولم نجد لهذا التفسير ذكراً في كتب أصحابنا) والذي يقرب إلىٰ الظنّ أنّه تفسير لبعض الأصحاب مرويّ عن الأئمّة الطاهرين عليهم‌السلام ، فسبيل هذا التفسير سبيل بحار العلوم ، المنسوب للإمام الصادق جعفر بن محمّد ‘ كما مرّ في (ج ٣ ص ٢٧)».

وقد استوعب الكلام حول هذا التفسير الدكتور حسن أنصاري في مقالة مفصّلة حول نسخ التفسير التي جمعها واختلافها والاحتمالات فيها ، وخلص إلىٰ أنّ التفسير ليس بتفسير النعماني ؛ لاختلاف المسلك ، وأنّه أقرب للصوفية ، وأنّ زيادات حصلت عليه مع احتمال كون أصله للإمامية ، وهو أمر لا نشكّ نحن فيه ، وما وقع الوهم إلّا من قبل الفهارس والمفهرسين.