الشيخ جعفر كاشف الغطاء وشرع في تأليفه سنة (١١٩٩هـ) ، وانتهى منه في سنة وفاته (طَابَ ثَرَاهُ) ، وهو مطبوع.

٢ ـ شرح طهارة الوافي : تقرير درس السيّد محمّد مهدي بحر العلوم قدس‌سره ، لم يتمّ.

٣ ـ حاشية على طهارة المدارك : وهي تقرير درس الشيخ حسين نجف قدس‌سره.

٤ ـ حاشية على الروضة : من كتاب المضاربة والوديعة والعارية والمزارعة والمساقاة وبعض الوصايا وتمام النكاح وبعض الطلاق.

٥ ـ حاشية على تجارة القواعد : وهي من تقرير السيّد محمّد مهدي بحر العلوم قدس‌سره.

٦ ـ حاشية على كتاب الدَّين وعلى كتاب الرهن من قواعد العلاّمة : وهي تقريرات درس الشيخ جعفر كاشف الغطاء (طَابَ ثَرَاهُ).

٧ ـ شرح وافية التوني قدس‌سره ، في مجلّدين.

٨ ـ حاشية على تهذيب الأصول (ناقصة).

٩ ـ حاشية على مقدّمة الواجب على المعالم.

١٠ ـ إجازة كبيرة : ذكر فيها جملة من مباحث علم الدراية.

رسائله :

١ ـ خروج المقيم إلى ما دون المسافة بعد صلاة تماماً عازماً على العود إلى موضع الإقامة من غير نيّة إقامة جديدة ، وهي الرسالة التي بين أيدينا ، وقد ألّفها بأمر السيّد محسن الأعرجي (طَابَ ثَرَاهُ) صاحب المحصول في علم