الروحيّين ، هذا مع ما يتحلّى به من الأخلاق السامية والكمالات العلميّة والعملية العالية التي انفرد بها من بين أقرانه.
أنجاله :
١ ـ الشيخ محمّد جعفر (١٣٠٨ هـ) : وكان من أعلام المحمّرة بعد عمّه الشيخ حبيب (١٣٠٦ هـ) ، وعقبه من ولده الشيخ باقر ، ثمّ الشيخ جعفر ابن الشيخ باقر.
٢ ـ الشيخ بهاء الدين : عرف بالعلم والزهد والتقوى وكان من العرفاء المنقطعين عن الدنيا وزخارفها ، أجازه والده وجماعة من معاصريه.
٣ ـ آية الله الشيخ جلال الدين الخاقاني الملقّب برئيس العلماء ولد في سنة (١٢٩٤ هـ) ونشأ على حبِّ العلم والفضيلة وبلغ مرتبة الاجتهاد بكدّه وسعيه وجدّه ، ورعاية والده الفقيه المتضلِّع والحكيم المتألّه البارع. قام مقام والده بعد وفاته وحظي بحفاوة وإقبال من عموم طبقات المؤمنين.
ولنقدّم ذكر مؤلّفات الشيخ جلال الدين :
١ ـ أجر التمام في أحكام الصيام : فرغ منه في ٢٢ شهر شعبان (١٣٣٠ هـ) كما في فهرس مكتبة خانقاه أحمدي في شيراز.
٢ ـ الإجازات : وهو يتضمّن إجازات أبو الحسن الأصفهاني والشيخ محمّد كاظم الشيرازي والشيخ محمّد طاهر الشيرازي لولده جلال الدين رئيس العلماء بضميمة ترجمة الوالد والولد المجاز وفهرسة لمؤلّفاتهما بقلم جلال الدين رئيس العلماء الشيرازي.