الجزء الرابع (طب) ويشمل ١٠ مخطوطات منها :

* الأزرقي اليمني الزبيدي : كتاب الطب ـ ٤٣٤.

* أحمد الدمنهوري : منتهى التصريح بمضمون القول الصريح في علم التشريح ـ ٤٣٦.

الجزء الخامس (فلك) ويشمل ١٦ مخطوطا منها :

* أبو القاسم الصوفي : كتاب الزيج في علم الفلك ـ ٤٤١.

الجزء السادس (علوم) ويشمل ٧ مخطوطات منها :

* أبو العباس أحمد بن عبد الله المعروف بابن البنا كتاب الجبر والمقابلة ـ ٤٥٧.

* عثمان بن محمد المرعي : شرح القواعد الوضاحة في علم المساحة ـ ٤٥٨.

الجزء السابع (العلوم الروحانية) ويشمل ١٥ مخطوطا منها :

* كامل الدين أبو سالم محمد بن طلحة البسطاني : الدرر المنظم في السّر الأعظم ـ ٤٧٢.

الجزء الثامن (الكيمياء) ويشمل ٨ مخطوطات منها :

* أبو نصر محمد بن طرخان الفارابي الفيلسوف : كتاب في علم المزاج ـ ٤٨٤.

الجزء التاسع (الدارسات القرآنية) ويشمل ١٩ مخطوطا منها :

* السيوطي : الإتقان في علوم القرآن ـ ٤٨٨.

* أبو إسحاق أحمد بن إبراهيم الثعالبي النيسابوري : الكشف والبيان في تفسير القرآن ـ ٤٨٩.

* محمد بن أحمد على الوليد القرشي : البرهان في علوم القرآن من الغريب والإعراب والتفسير والأحكام والناسخ والمنسوخ والاشتقاق من ... ، والوقف وأعداد الآي ـ ٤٩٣.