( المسائل البغدادية ) التي للشيخ جمال الدين يوسف بن حاتم الشامي العاملي المشغري ، تلميذ المحقق الحلي سألها عن أستاذه المحقق فأجاب عنها الأستاد وهو الشيخ المحقق أبو القاسم جعفر بن حسن بن يحيى بن سعيد الحلي المتوفى سنة ست وسبعين وستمائة موجود في الخزانة الرضوية ومرت بعنوان الجواب ٥ : ٢١٥ وهو مع الغرية والمصرية عند ميرزا نصر الله بن الحاج مجتهد القزويني.
( ٣٢٩٤ : المسائل البغدادية ) في النحو أيضا للشيخ أبي علي الفارسي النحوي ذكره وسابقة أي البصريات في مختصر تاريخ ابن خلكان على ما حكي عنه ومر جوابات المسائل البغداديات متعددة.
( ٣٢٩٥ : المسائل البغدادية ) عشرون مسألة للحاج شيخ عبد الله المامقاني طبع بالنجف ١٣٤٦ ومعه رد البابية للميرزا يحيى بن محمد رحيم الأرومي.
( ٣٢٩٦ : مسائل البلدان ) لأبي محمد الفضل بن شاذان بن الخليل الأزدي النيسابوري ومر جوابات مسائل البلدان أيضا في الجيم.
( ٣٢٩٧ : المسائل البهبهانية ) في بعض أحكام البيانية كلها في أحكام الأموات من الغسل والكفن والصلاة والدفن ، للشيخ عبد الله بن صالح السماهيجي ألفه في بهبهان وفرغ منه ضحى الرابع من جمادى الأولى ١١٢٨ وأحال فيه إلى المسائل المحمدية له ضمن مجموعة من كتب السيد خليفة.
( المسائل البهبهانية ) مر بعنوان جوابات المسائل البهبهانية ٥ : ٢١٦ للشيخ يوسف ، ونسخه منها عند السيد شهاب الدين ، أكثرها فقهية ، سألها السيد عبد الله بن علوي بن الحسين الغريفي عن صاحب الحدائق فكتب جواباته في ١١٥٦ ضمن مجموعة من رسائل الشيخ يوسف بخط تلميذه الشيخ علي بن علي التستري ١١٧٢ أولها : [ لك الحمد يا من ترادفت علينا آلائه فلا يحيط بها العدد وتواترت لدنيا نعمائه فلا نهاية لها ].
( ٣٢٩٨ : المسائل التداخلية ) في فروع تداخل الأسباب أو المسببات كتداخل الأحداث في الوضوء والغسل وتداخل الأغسال وتداخل منزوحات البئر