(يَأْتِيَ :) فعل مضارع منصوب بأن وعلامة نصبه الفتحة الظاهرة على آخره ، والفاعل ضمير مستتر جوازا تقديره هو والمصدر المنسبك من أن والفعل في محل رفع اسم كان مؤخر ، والجملة استئنافية لا محل لها من الاعراب.
(بِآيَةٍ :) الجار والمجرور متعلقان بالفعل (يأتي).
(إِلَّا :) حرف استثناء ملغى.
(بِإِذْنِ :) الباء حرف جر ، إذن : اسم مجرور بالياء وعلامة جره الكسرة الظاهرة على آخره مضاف.
(اللهِ :) لفظ الجلالة مضاف إليه مجرور وعلامة جره الكسرة الظاهرة على آخره والجار والمجرور متعلقان بالفعل يأتي.
(لِكُلِّ :) الجار والمجرور متعلقان بمحذوف خبر مقدم مضاف.
(أَجَلٍ :) مضاف إليه مجرور بالكسرة الظاهرة على آخره.
(كِتابٌ :) مبتدأ مؤخر مرفوع وعلامة رفعه الضمة الظاهرة على آخره.
(يَمْحُوا اللهُ ما يَشاءُ وَيُثْبِتُ وَعِنْدَهُ أُمُّ الْكِتابِ (٣٩))
(يَمْحُوا :) فعل مضارع مرفوع لتجرده من الناصب والجازم وعلامة رفعه الضمة المقدرة منع من ظهورها الثقل.
(اللهُ :) لفظ الجلالة فاعل مرفوع وعلامة رفعه الضمة الظاهرة على آخره.
(ما :) اسم موصول مبني على السكون في محل نصب مفعول به.
(يَشاءُ :) فعل مضارع مرفوع لتجرده من الناصب والجازم وعلامة رفعه الضمة الظاهرة على آخره والفاعل ضمير مستتر جوازا تقديره هو والجملة صلة الموصول لا محل لها من الاعراب والعائد محذوف تقديره يشاؤه.
(وَيُثْبِتُ :) الواو حرف عطف ، يثبت : فعل مضارع مرفوع لتجرده من الناصب والجازم وعلامة رفعه الضمة الظاهرة على آخره ، والفاعل ضمير مستتر فيه جوازا تقديره هو والجملة معطوفة لا محل لها من الاعراب.