السيد المرعشي رقم ٣٣٦٣ ذكرت في فهرسها ٩ / ١٣٨.

١٢ ـ مخطوطة من القرن ٨ أو ٩ عليها حواشي منه وفي نهايتها سؤال وجه إلى ابن المصنف عن مصطلحات والده رحمهم‌الله ورموزة التي استعملها في كتاب القواعد وجواب فخر المحققين على هذا السؤال وبيان المصطلحات والرموز مكتوبة عن خطه رحمهم‌الله.

وهي في المكتبة المركزية بجامعة طهران رقم ٣٥٦٠ ذكرت في فهرسها ١٢ / ٢٥٨٠.

١٣ ـ مخطوطة كتبها هبة الله بن محمد الاستر آبادي التفائي وفرغ يوم الاثنين غرة ذي القعدة سنة ٨٣٠ برسم سعد الدين ابن مجد الدين بن فضل الله ، نزيل مشهد الرضا عليه‌السلام عليها حواش وتصحيحات.

وهي في مكتبة السيد المرعشي رقم ٢٨٠٥ ذكرت في فهرسها ٨ / ٧.

١٤ ـ مخطوطة كتبت حدود سنة ٨٣٧ ولعلها بخط الحسن بن حمزة الحسيني الموسوي النجفي فقد قرأه على جعفر بن احمد بن مكي بن الحسن فكتب له سماعا واجازة اطراه فيها بقوله :

قرأ علي السيد المولى العالم العامل مفخر آل طه وياسين الفائق على أقرانه ، سلالة آبائه المعصومين السيد عز الدين حسن ابن السيد السعيد الطاهر السيد حمزة ابن المولى النقيب الطاهر أبو القاسم بن محسن الحسيني هذا الكتاب ... من أوله إلى آخره قراءة مهذبة مرضية تشهد بفضله وغزارة علمه وسأل في اثناء قراءته وتضاعيف مباحثته عما استشكل عليه من فقه الكتاب فبينت له ذلك بيانا شافيا واوضحت له ايضاحا كافيا وقد اجزت له ان يروي عني ذلك كما اجازني شيخي المولى الإمام قدوة